Marvel's Wolverine, olası bir devam oyunu için birçok ipucu açıkta bırakıyor ve tipik Marvel üslubunda en doğrudan mesaj kredi sonrası sahnede gizli. X-Men hikâyelerine aşina değilseniz ya da Insomniac'ın klasik Logan mitolojisine getirdiği yorum biraz kafa karıştırıcıysa, kredi sonrası sahnenin nereye işaret ettiğini merak ediyor olabilirsiniz. Oyun, X-Men karakterlerinin geçmiş hikâyelerini nasıl yeniden yorumlayıp yeni oyun için alan açtığını kısaca özetleyelim.
Oyun iki kredi sonrası sahne içeriyor. İlki tüm oyuncular için açılıyor, ikincisini görmek için biraz çaba gerekiyor. İlk sahnede Sabretooth'un, oyun boyunca uyuyan mutantları harekete geçirmek için kullanılan bir cihaz olan Helix Engine'e benzeyen başka bir Helix Engine'i ortaya çıkardığını görüyoruz. Bu cihaz, oyun boyunca yeniden inşa edilip kullanılan olandan farklı olarak hâlâ sağlam görünüyor. Bunu yapmasının nedeni, Helix Engine'i kendisi kullandığı zamandan beri kafasında takılı kalan Apocalypse'in sesini takip etmesi.
Apocalypse'in sesi Wolverine boyunca duyulsa da oyun bunu pek açıklamıyor. Apocalypse ya da En Sabah Nur, X-Men serisinin uzun süredir var olan bir kötü karakteri. Mısır'da Wolverine'de karşılaştığımız kahramanlardan yüzyıllar önce doğdu ve dünyanın ilk mutantlarından biri olduğuna inanılıyor. Marvel evreninin en güçlü kötüleri arasında gösteriliyor; moleküler yapısını değiştirebiliyor, ayrıca insanüstü güç ve inanılmaz psişik güce sahip.
Apocalypse'in hikâyesinin önemli bir parçası, onun "dört atlı" tarafından takip edilmesi. Bu ifade, kıyamet gününü temsil eden kıtlık, ölüm, savaş ve veba olmak üzere dört bireye gönderme yapıyor. Bu grubun üyeleri farklı dönemlerde değişti. En bilinen kadrolardan biri Fox filmlerindeki Storm, Psylocke, Archangel ve Magneto dörtlüsü. Marvel's Wolverine zaman çizgisinde Sabretooth'un da aralarında olduğu görünüyor, ancak diğer üç ismin kim olduğu şu an belirsiz. Marvel evrenindeki herkes olabilirler, Insomniac'ın bu versiyon için kimin gölgelerden çıkacağını göreceğiz. Logan, uzun yaşamı boyunca bir noktada Ölüm Atlısı olarak tanıtıldı; oyun boyunca bu anılarını yeniden kazanıyor ve Jean, Apocalypse'in etkisini zihninden silerken çoğu anısıyla birlikte bu rolü yeniden üstlenmek üzereyken onu durdurdu.

İkinci kredi sonrası sahne, oyunu bitirdikten ve her Nightmare Door denemesinde en az bronz derecesi aldıktan sonra izlenebiliyor. Burada Logan'ı, ana hikâyeden 75 yıl önce, kendisinin ve Jean'in bir zamanlar yaşadığı çiftlikte yürürken görüyoruz. Jean, Logan'la yüzlerce yıl önce nasıl tanıştığını ve ilk kez Ölüm'ü onun zihninden nasıl yaktığını tümüyle anlatıyor. O zamandan beri bir anka kuşu gibi birçok kez öldü ve yeniden doğdu, ikisi her zaman birbirini bulmayı başardı. Geri dönüş, ikilinin birlikte kulübeye çekilmesiyle bitiyor; bu, pek çok yaşamları boyunca geriye kalan birkaç mutlu anıdan biri.
Wolverine'in sonunda Logan'ın hafızası silindiği için o, Jean ve arkadaşlarını geride bırakıp kendini bulmaya ve bir zamanlar kim olduğunu oluşturan parçalardan en azından bir kısmını geri kazanmaya çalışıyor. Oyun iyi giderse ve Insomniac ileride bir devam oyunu yaparsa bunun nasıl sonuçlanacağını göreceğiz.